Shadow Punisher, çözülmesi imkânsız görünen olayların ardındaki gerçeği ortaya çıkarmaya çalışan üç dedektifin tehlikeli serüvenine odaklanıyor. Li Si, Dördüncü Prens’in gizemli ölümünü araştırabilmek için kendi kimliğini geri planda tutarak İmparatorluk Dedektiflik Birimi’ne dahil olur. Burada titiz incelemeleriyle suç mahallerini konuşturan Bai Zhenzhu ve güçlü savaş yeteneklerinin yanında karanlık geçmişiyle dikkat çeken Meng Rui ile tanışır. Zamanla aralarındaki ortaklık yalnızca görev ilişkisi olmaktan çıkar ve onları ölümcül tehditler karşısında birbirine bağlar. Çözmeleri gereken sekiz vaka, normal suç dosyalarının çok ötesindedir. Garip ritüeller, kaybolan deliller, sahte hayalet hikâyeleri ve yüksek mevkilerdeki isimlerin gizlediği sırlar soruşturmaları giderek karmaşıklaştırır. Li Si her adımda Dördüncü Prens’in ölümünün büyük bir siyasi planla bağlantılı olabileceğini fark etmeye başlar.